| No. | Foto | Nama | Dari | Sampai | Asal Fakultas | Keterangan |
| 1. |  | Prof. Dr. M.
Sardjito | 1949 | 1961 | Fakultas Kedokteran, Kesehatan Masyarakat, dan Keperawatan | |
| 2. |  | Prof. Dr. Ir.
Herman Johannes | 1961 | 1966 | Fakultas Teknik | |
| 3. | | drg.
M. Nazir Alwi | 1966 | 1967 | Fakultas Kedokteran Gigi | |
| 4. |  | Drs.
Soepojo Padmodipoetro
MA | 1967 | 1968 | Fakultas Ekonomika dan Bisnis | |
| 5. |  | Prof. Dr.
Soeroso H. Prawirohardjo
MA | 1968 | 1973 | Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik | |
| 6. |  | Prof. Dr.
Sukadji Ranuwihardjo
MA | 1973 | 1981 | Fakultas Ekonomika dan Bisnis | |
| 7. |  | Prof. Dr.
Teuku Jacob
MS, DS | 1981 | 1986 | Fakultas Kedokteran, Kesehatan Masyarakat, dan Keperawatan | |
| 8. |  | Prof. Dr.
Koesnadi Hardjasoemantri
S.H, M.L | 1986 | 1990 | Fakultas Hukum | |
| 9. |  | Prof. Dr. Ir.
Mohammad Adnan | 1990 | 1994 | Fakultas Teknologi Pertanian | |
| 10. |  | Prof. Dr.
Soekanto H. Reksohadiprodjo
M.Com | 1994 | 1998 | Fakultas Ekonomika dan Bisnis | |
| 11. |  | Prof. Drs.
Ichlasul Amal
MA, Ph.D. | 1998 | 2002 | Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik | |
| 12. |  | Prof. Dr.
Sofian Effendi
MA, MPIA, Ph.D. | 2002 | 2007 | Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik | |
| 13. |  | Prof. Ir.
Soedjarwadi
M.Eng, Ph.D | 2007 | 2012 | Fakultas Teknik | |
| 14. |  | Prof. Dr.
Pratikno
M.Soc.Sc. | 2012 | 2014 | Fakultas Ilmu Sosial dan Ilmu Politik | |
| 15. |  | Prof. Ir.
Dwikorita Karnawati
M.Sc., Ph.D | 2014 | 2017 | Fakultas Teknik | [1] |
| 16 |  | Prof. Ir.
Panut Mulyono
M.Eng., D.Eng., IPU.ASEAN.Eng. | 2017 | 2022 | Fakultas Teknik | |
| 17 |  | Prof. dr.
Ova Emilia
M.Med.Ed., Sp.OG(K)., Ph.D. | 2022 | petahana | Fakultas Kedokteran, Kesehatan Masyarakat, dan Keperawatan | |
