DNA purba

DNA purba (ancient DNA, aDNA) adalah DNA yang diisolasikan dari sumber purbanya (biasaya spesimen, tetapi juga dapat berupa DNA lingkungan.^[1][2] Karena proses-proses penguraian (termasuk penautan silang, deaminasi, dan fragmentasi),^[3] DNA purba lebih buruk keondisinya ketimbang material genetik masa kini.^[4] Materi genetik telah diambil dari material rangka bersejarah, paleontologis, atau arkeologis, jaringan termumifikasi, koleksi arsip spesimen medis yang tidak dibekukan, sisa-sisa tumbuhan yang terawetkan, es dan dari inti ibun abadi, serta sedimen darat dan tanah galian.

Bahkan meski berada pada kondisi pengawetan terbaik, terdapat sebuah batas waktu selama 0.4-1.5 juta tahun untuk sebuah sampel dapat mengandung cukup DNA untuk diurutkan.^[5] DNA tertua yang diurutkan dari sebuah spesimen fisik adalah DNA dari geraham mamut di Siberia yang berusia lebih dari 1 juta tahun.^[6] Pada 2022, material genetik berusia 2 juta tahun ditemukan dari sedimen di Greenland, dan kini itu dianggap sebagai DNA tertua yang pernah ditemukan hingga ini.^[7][8]

Referensi

1. ↑ Pevsner J (2015). Bioinformatics and Functional Genomics (Edisi 3rd). Wiley-Blackwell. ISBN 978-1-118-58178-0.
2. ↑ Jones M (2016). Unlocking the Past: How Archaeologists Are Rewriting Human History with Ancient DNA. Arcade. ISBN 978-1-62872-447-9.
3. ↑ Anderson LA (Mei 2023). "A chemical framework for the preservation of fossil vertebrate cells and soft tissues". Earth-Science Reviews. 240 104367. Bibcode:2023ESRv..24004367A. doi:10.1016/j.earscirev.2023.104367. S2CID 257326012.{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link)
4. ↑ Allentoft ME, Collins M, Harker D, Haile J, Oskam CL, Hale ML, Campos PF, Samaniego JA, Gilbert MT, Willerslev E, Zhang G, Scofield RP, Holdaway RN, Bunce M (Desember 2012). "The half-life of DNA in bone: measuring decay kinetics in 158 dated fossils". Proceedings. Biological Sciences. 279 (1748): 4724–33. doi:10.1098/rspb.2012.1745. PMC 3497090. PMID 23055061.{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link)
5. ↑ Willerslev E, Hansen AJ, Rønn R, Brand TB, Barnes I, Wiuf C, Gilichinsky D, Mitchell D, Cooper A (Januari 2004). "Long-term persistence of bacterial DNA" (PDF). Current Biology. 14 (1): R9-10. Bibcode:2004CBio...14...R9W. doi:10.1016/j.cub.2003.12.012. PMID 14711425. S2CID 12227538.{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link)
6. ↑ van der Valk T, Pečnerová P, Díez-Del-Molino D, Bergström A, Oppenheimer J, Hartmann S, Xenikoudakis G, Thomas JA, Dehasque M, Sağlıcan E, Fidan FR, Barnes I, Liu S, Somel M, Heintzman PD, Nikolskiy P, Shapiro B, Skoglund P, Hofreiter M, Lister AM, Götherström A, Dalén L (Maret 2021). "Million-year-old DNA sheds light on the genomic history of mammoths". Nature. 591 (7849): 265–269. Bibcode:2021Natur.591..265V. doi:10.1038/s41586-021-03224-9. PMC 7116897. PMID 33597750.{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link)
7. ↑ Zimmer C (7 Desember 2022). "Oldest Known DNA Offers Glimpse of a Once-Lush Arctic - In Greenland's permafrost, scientists discovered two-million-year-old genetic material from scores of plant and animal species, including mastodons, geese, lemmings and ants". The New York Times. Diakses tanggal 7 Desember 2022.{{cite news}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link)
8. ↑ Kjær KH, Winther Pedersen M, De Sanctis B, De Cahsan B, Korneliussen TS, Michelsen CS, Sand KK, Jelavić S, Ruter AH, Schmidt AM, Kjeldsen KK, Tesakov AS, Snowball I, Gosse JC, Alsos IG, Wang Y, Dockter C, Rasmussen M, Jørgensen ME, Skadhauge B, Prohaska A, Kristensen JÅ, Bjerager M, Allentoft ME, Coissac E, Rouillard A, Simakova A, Fernandez-Guerra A, Bowler C, Macias-Fauria M, Vinner L, Welch JJ, Hidy AJ, Sikora M, Collins MJ, Durbin R, Larsen NK, Willerslev E (Desember 2022). "A 2-million-year-old ecosystem in Greenland uncovered by environmental DNA". Nature. 612 (7939): 283–291. Bibcode:2022Natur.612..283K. doi:10.1038/s41586-022-05453-y. PMC 9729109. PMID 36477129.{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link)