SIM1

SIM1
Pengidentifikasi
Alias	SIM1, bHLHe14, single-minded family bHLH transcription factor 1, SIM bHLH transcription factor 1
ID Eksternal	OMIM: 603128; MGI: 98306; HomoloGene: 3715; GeneCards: SIM1; OMA:SIM1 - orthologs
Pola ekspresi RNA Bgee Manusia Tikus (ortologi) Ekspresi tertinggi di renal medulla Skeletal muscle tissue of biceps brachii penis manusia Skeletal muscle tissue of rectus abdominis corpus epididymis caput epididymis Testis Otot vastus lateralis Pulau Langerhans kidney tubule Ekspresi tertinggi di supraoptic nucleus inner renal medulla paraventricular nucleus of hypothalamus lumbar subsegment of spinal cord mammillary body right kidney dorsomedial hypothalamic nucleus soleus muscle outer renal medulla Kapsula Bowman Referensi data ekspresi selengkapnya BioGPS Data ekspresi referensi lebih lanjut
Ontologi gen Fungsi molekuler DNA-binding transcription factor activity DNA binding protein dimerization activity protein heterodimerization activity DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Komponen seluler Inti sel Proses biologis regulation of transcription by RNA polymerase II multicellular organism development Diferensiasi sel ureteric bud development regulation of transcription, DNA-templated transcription, DNA-templated perkembangan sistem saraf Sumber:Amigo / QuickGO
Ortologi Spesies Manusia Tikus Entrez 6492 20464 Ensembl ENSG00000112246 ENSMUSG00000019913 UniProt P81133 Q61045 RefSeq (mRNA) NM_005068 NM_001374769 NM_011376 RefSeq (protein) NP_005059 NP_001361698 NP_035506 Location (UCSC) n/a n/a PubMed search [1] [2]
Wikidata
Lihat/Sunting Manusia Lihat/Sunting Tikus

Homolog 1-minded 1 juga dikenal sebagai protein helix-loop-helix kelas E basa 14 (bHLHe14) adalah protein yang pada manusia disandi oleh gen SIM1.^[3][4][5]

Fungsi

Gen SIM1 dan SIM2 adalah homolog dari single-minded (sim) pada Drosophila melanogaster, dinamakan demikian karena sel-sel di garis tengah embrio mutan gagal gagal berkembang dengan baik dan akhirnya mati, dan dengan demikian pasangan ikatan akson memanjang yang menjangkau sumbu anterior-posterior embrio (analog dengan sumsum tulang belakang embrio) runtuh menjadi bundel akson rudimenter "tunggal" di garis tengah. Sim adalah helix-loop-helix basa - faktor transkripsi domain PAS yang mengatur ekspresi gen dalam sel garis tengah. Karena gen sim memainkan peran penting dalam pengembangan Drosophila dan memiliki tingkat puncak ekspresi selama periode neurogenesis, diusulkan bahwa gen SIM2 manusia, yang berada di wilayah kritis kromosom 21, adalah kandidat untuk keterlibatan dalam sifat dysmorphic tertentu (terutama karakteristik wajah dan tengkorak), kelainan perkembangan otak, dan/atau keterbelakangan mental sindrom Down.^[5]

Signifikansi klinis

Haploinsufisiensi SIM1 telah terbukti menyebabkan obesitas awal-awal yang parah pada seorang gadis dengan translokasi seimbang de novo antara kromosom 1p22.1 dan 6q16.2^[6] dan telah disarankan untuk menyebabkan fenotipe seperti Prader-Willi pada kasus lainnya.^[7] Selain itu, penelitian pada tikus menunjukkan bahwa haploinsufisiensi dari Sim1 menyebabkan obesitas yang disebabkan oleh hiperfagia dan tidak merespons dengan baik terhadap peningkatan lemak makanan.^[4][8] Ekspresi berlebihan SIM1 melindungi terhadap obesitas yang disebabkan oleh diet dan menyelamatkan hiperfagia dari tikus kuning agouti,^[9] yang telah mengganggu pensinyalan melanokortin. Obesitas dan hiperfagia dapat diperantarai oleh gangguan aktivasi melanokortin dari neuron PVN^[10] dan defisiensi oksitosin pada tikus ini.^[11] Telah dibuktikan bahwa memodulasi level Sim1 postnatal juga mengarah ke hiperfagia dan obesitas,^[12][13] menyarankan peran fisiologis untuk Sim1 terpisah dari perannya dalam pengembangan.

Matharu dan sejawat menguji apakah sistem aktivasi berbasis CRISPR (CRISPRa) dapat menyelamatkan fenotip haploinsufisiensi dengan meningkatkan level ekspresi gen dari salinan normal yang ada. Dengan mengirimkan sistem ini ke hipotalamus tikus menggunakan virus yang terkait dengan adeno, mereka menyelamatkan fenotip obesitas yang disebabkan oleh haploinsufisiensi salah satu dari dua gen yang diketahui mempromosikan obesitas ketika bermutasi pada tikus dan manusia. Hasil ini menyoroti potensi translasi dari sistem aktivasi CRISPR untuk mengobati penyakit haploinsufisiensi.^[14]

Interaksi

SIM1 telah terbukti berinteraksi dengan translokator inti reseptor aril hidrokarbon.^[15][16]

Referensi