| Kromosom 5 | |
|---|---|
 Pasangan kromosom 5 manusia setelah pemitaan G. Satu dari ibu, dan satu dari ayah. | |
 Pasangan kromosom 5
dalam kariogram manusia laki-laki | |
| Ciri | |
| Panjang (bp) | 182,045,439 bp (CHM13) |
| No. gen | 839 (CCDS)[1] |
| Jenis | Autosom |
| Posisi sentromer | Submetasentris[2] (48.8 Mbp[3]) |
| Daftar gen lengkap | |
| CCDS | Daftar gen |
| HGNC | Daftar gen |
| UniProt | Daftar gen |
| NCBI | Daftar gen |
| Penampil peta eksternal | |
| Ensembl | Chromosome 5 |
| Entrez | Chromosome 5 |
| NCBI | Chromosome 5 |
| UCSC | Chromosome 5 |
| Urutan DNA lengkap | |
| RefSeq | NC_000005 (FASTA) |
| GenBank | CM000667 (FASTA) |
Kromosom 5 adalah salah satu dari 23 pasang kromosom pada manusia. Umumnya manusia memiliki dua salinan dari kromosom ini. Kromosom 5 membentang sepanjang 182 juta pasangan basa (bahan pembangun DNA), serta mewakili hampir 6% dari total DNA dalam sel. Kromosom 5 adalah kromosom manusia terbesar ke-5, tetapi memiliki salah satu kepadatan gen yang paling rendah. Hal ini sebagian dijelaskan karena banyaknya wilayah yang miskin-gen, yang menunjukkan tingkat konservasi sintenik dan non-penyandi dengan vertebrata non-mamalia, menyarankan bahwa mereka terbatas secara fungsional.
Karena kromosom 5 bertanggungjawab atas banyak wujud perubahan-perubahan pertumbuhan dan perkembangan (pembelahan sel), perubahan dalam kromosom ini dapat menyebabkan kanker. Contohnya adalah leukemia mieloid akut (acute myeloid leukemia, AML).[4]
Jumlah gen
Berikut adalah estimasi jumlah gen untuk kromosom manusia 1. Karena ahli-ahli menggunakan pendekatan-pendekatan yang berbeda untuk menganotasikan genom, perkiraan-perkiraan jumlah gen pada setiap kromosom berbeda. Di antara proyek-proyek lainnya, Proyek Pengurutan Koding Konsensus Kolaboratif (CCDS) menggunakan sebuah strategi yang sangat konservatif. Oleh karena itu, prediksi jumlah gen oleh CCDS mewakili batas ambang bawah untuk jumlah total gen-gen penyandi-protein manusia.[5]
| Diperkirakan oleh | Gen penyandi protein | Gen RNA non-penyandi | Pseudogen | Sumber | Tanggal terbit |
|---|---|---|---|---|---|
| CCDS | 839 | — | — | [1] | 2016-09-08 |
| HGNC | 790 | 355 | 574 | [6] | 2017-05-12 |
| Ensembl | 882 | 1,207 | 707 | [7] | 2017-03-29 |
| UniProt | 875 | — | — | [8] | 2018-02-28 |
| NCBI | 886 | 981 | 785 | [9][10][11] | 2017-05-19 |
Referensi
- 1 2 "Search results - 5[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("has ccds"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. CCDS Release 20 for Homo sapiens. 2016-09-08. Diakses tanggal 2017-05-28.
- ↑ Tom Strachan; Andrew Read (2 April 2010). Human Molecular Genetics. Garland Science. hlm. 45. ISBN 978-1-136-84407-2.
{{cite book}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - ↑ Genome Decoration Page, NCBI. Ideogram data for Homo sapience (850 bphs, Assembly GRCh38.p3). Last update 2014-06-03. Retrieved 2017-04-26.
- ↑ "Chromosome 5". Genetics Home Reference. Lister Hill National Center for Biomedical Communications. U.S. National Library of Medicine. Desember 2014.
{{cite web}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - ↑ Pertea M, Salzberg SL (2010). "Between a chicken and a grape: estimating the number of human genes". Genome Biol. 11 (5): 206. doi:10.1186/gb-2010-11-5-206. PMC 2898077. PMID 20441615.
- ↑ "Statistics & Downloads for chromosome 5". HUGO Gene Nomenclature Committee. 2017-05-12. Diarsipkan dari asli tanggal 2017-06-29. Diakses tanggal 2017-05-19.
- ↑ "Chromosome 5: Chromosome summary - Homo sapiens". Ensembl Release 88. 2017-03-29. Diakses tanggal 2017-05-19.
- ↑ "Human chromosome 5: entries, gene names and cross-references to MIM". UniProt. 2018-02-28. Diakses tanggal 2018-03-16.
- ↑ "Search results - 5[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.
- ↑ "Search results - 5[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ( ("genetype miscrna"[Properties] OR "genetype ncrna"[Properties] OR "genetype rrna"[Properties] OR "genetype trna"[Properties] OR "genetype scrna"[Properties] OR "genetype snrna"[Properties] OR "genetype snorna"[Properties]) NOT "genetype protein coding"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.
- ↑ "Search results - 5[CHR] AND "Homo sapiens"[Organism] AND ("genetype pseudo"[Properties] AND alive[prop]) - Gene". NCBI. 2017-05-19. Diakses tanggal 2017-05-20.