Retrovirus endogen atau Endogenous retroviruses (ERVs) adalah unsur virus yang terdapat dalam genom dan sangat mirip bahkan kemungkinan berasal dari retrovirus. Unsur ini banyak dijumpai pada genom vertebrata berahang, dan dapat mencapai 5–8% dari genom manusia (perkiraan terendah sekitar ~1%).[1][2]
ERV adalah urutan provirus yang diturunkan secara turun-temurun dan merupakan subkelas dari jenis gen yang dikenal sebagai transposon, yang pada umumnya dapat dikemas dan berpindah-pindah di dalam genom, berperan penting dalam ekspresi gen dan pengaturannya.[3][4] Namun, ERV kehilangan sebagian besar fungsi transposon, biasanya tidak bersifat menular, dan seringkali merupakan sisa genom yang cacat dari siklus replikasi retrovirus.[5][6]
Mereka dibedakan sebagai retroelemen provirus pada garis keturunan karena penyisipan dan transkripsi baliknya ke dalam genom inti sel inang. Para peneliti menyarankan bahwa retrovirus berevolusi dari jenis transposon yang disebut retrotransposon, sebuah elemen Kelas I; gen-gen semacam ini dapat bermutasi dan, alih-alih berpindah tempat dalam genom, dapat menjadi eksogen atau bersifat patogen. Hal ini menunjukkan bahwa tidak semua ERV mungkin berasal dari penyisipan oleh retrovirus; beberapa ERV bahkan mungkin menjadi sumber bagi bahan genetik retrovirus yang mirip mereka.[7]
Ketika integrasi DNA virus berlangsung pada garis keturunan—misalnya pada sel kelamin—hal itu dapat melahirkan sebuah ERV, yang kemudian berpeluang menjadi tetap (terfixasi) dalam kumpulan gen pada populasi inang.[1][8]
Referensi
- 1 2 Belshaw R, Pereira V, Katzourakis A, Talbot G, Paces J, Burt A, Tristem M (April 2004). "Long-term reinfection of the human genome by endogenous retroviruses". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101 (14): 4894–4899. Bibcode:2004PNAS..101.4894B. doi:10.1073/pnas.0307800101. PMC 387345. PMID 15044706.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - ↑ Nelson PN, Hooley P, Roden D, Davari Ejtehadi H, Rylance P, Warren P, et al. (Oktober 2004). "Human endogenous retroviruses: transposable elements with potential?". Clinical and Experimental Immunology. 138 (1): 1–9. doi:10.1111/j.1365-2249.2004.02592.x. PMC 1809191. PMID 15373898.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - ↑ Khodosevich K, Lebedev Y, Sverdlov E (Oktober 2002). "Endogenous retroviruses and human evolution". Comparative and Functional Genomics. 3 (6): 494–498. doi:10.1002/cfg.216. PMC 2448423. PMID 18629260.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - ↑ Kim FJ, Battini JL, Manel N, Sitbon M (Januari 2004). "Emergence of vertebrate retroviruses and envelope capture". Virology. 318 (1): 183–191. doi:10.1016/j.virol.2003.09.026. PMID 14972546.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - ↑ Stoye JP, Boeke JD (1997). "Retrotransposons, Endogenous Retroviruses, and the Evolution of Retroelements". Retroviruses. Cold Spring Harbor (NY): Cold Spring Harbor Laboratory Press. hlm. 343. ISBN 9780879695712. PMID 21433351. NBK19468. Diakses tanggal 2021-02-22.
- ↑ Gifford RJ, Blomberg J, Coffin JM, Fan H, Heidmann T, Mayer J, et al. (Agustus 2018). "Nomenclature for endogenous retrovirus (ERV) loci". Retrovirology. 15 (1) 59. doi:10.1186/s12977-018-0442-1. PMC 6114882. PMID 30153831.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - ↑ Cotton, J. (2001). "Retroviruses from retrotransposons". Genome Biology. 2 (2) reports0006: 6. doi:10.1186/gb-2001-2-2-reports0006. It appears that the transition from nonviral retrotransposon to retrovirus has occurred independently at least eight times, and the source of the envelope gene responsible for infectious ability can now be traced to a virus in at least four of these instances. This suggests that potentially, any LTR retrotransposon can become a virus through the acquisition of existing viral genes.
- ↑ Johnson WE, Coffin JM (Agustus 1999). "Constructing primate phylogenies from ancient retrovirus sequences". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 96 (18): 10254–10260. Bibcode:1999PNAS...9610254J. doi:10.1073/pnas.96.18.10254. PMC 17875. PMID 10468595.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link)
Bacaan lanjutan
- Löwer R, Löwer J, Kurth R (Mei 1996). "The viruses in all of us: characteristics and biological significance of human endogenous retrovirus sequences". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 93 (11): 5177–5184. Bibcode:1996PNAS...93.5177L. doi:10.1073/pnas.93.11.5177. PMC 39218. PMID 8643549.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - Molès JP, Tesniere A, Guilhou JJ (Juli 2005). "A new endogenous retroviral sequence is expressed in skin of patients with psoriasis". The British Journal of Dermatology. 153 (1): 83–89. doi:10.1111/j.1365-2133.2005.06555.x. PMID 16029331. S2CID 6642536.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - Seifarth W, Frank O, Zeilfelder U, Spiess B, Greenwood AD, Hehlmann R, Leib-Mösch C (Januari 2005). "Comprehensive analysis of human endogenous retrovirus transcriptional activity in human tissues with a retrovirus-specific microarray". Journal of Virology. 79 (1): 341–352. doi:10.1128/JVI.79.1.341-352.2005. PMC 538696. PMID 15596828.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - Knerr I, Beinder E, Rascher W (Februari 2002). "Syncytin, a novel human endogenous retroviral gene in human placenta: evidence for its dysregulation in preeclampsia and HELLP syndrome". American Journal of Obstetrics and Gynecology. 186 (2): 210–213. doi:10.1067/mob.2002.119636. PMID 11854637.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link) - Gifford R, Tristem M (Mei 2003). "The evolution, distribution and diversity of endogenous retroviruses" (PDF). Virus Genes. 26 (3): 291–315. doi:10.1023/A:1024455415443. PMID 12876457. S2CID 34639116. Diarsipkan dari asli (PDF) tanggal 2013-02-15. Diakses tanggal 2008-01-16.
{{cite journal}}: Pemeliharaan CS1: Tanggal diterjemahkan otomatis (link)